回答
你好，根据你所说的这个情况，生殖器疱疹病毒是不能彻底清除干净的。
人体一旦感染生殖器疱疹，这个病毒是难以彻底清除干净的，后期主要是提高自身的免疫力，用自身的免疫力抑制病毒，减少复发，至于这个疾病与衣原体没有必然的联系的，但这个都是性病，都是通过性行为传播的，如果你有过不安全的性行为，那么这两种疾病也有可能会同时感染上的。
以上是对“生殖器疱疹病毒一辈子都治不好吗”这个问题的建议，希望对您有帮助，祝您健康！
根据描述，你的情况考虑是有病毒感染引起的生殖器疱疹。
治疗参考：生殖器疱疹的病毒一般是不能从体内完全根除。但是可以通过提高免疫力，使它不复发，这种情况是完全可以达到的。
