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在胚胎期第6周时,其原始性腺都是一样的,后来两侧的生殖腺在中线合并成生殖结节,如胎儿为男性,体内的Y染色体就使性腺演变成睾丸,睾丸分泌的男性激素就使生殖结节逐步演变成阴茎,如果在此时母亲因患病、服药或外界环境的影响,使胎儿生殖腺未能合并成一个生殖结节,那么胎儿就可以在两个生殖结节的基础上发育成两个阴茎,
双阴茎虽不多见,但形状多种多样,而且常同时有身体上的其他畸形,一般可分两种类型:一种是分支阴茎,即阴茎被纵形分隔为二,分隔可只发生在阴茎头部,而阴茎体是一个,因而呈“Y”型;也可以分隔在根部,而呈倒“Y”型,另一种是完全分离的两个完整阴茎,但两个阴茎可以是完全分开的,也可以是相互依附在一起,有的左右并行,有的前后重复,两个阴茎可以各有尿道通向膀胱,因此两个可以同时排尿,也可以在不同时间分别排尿,有的则是一个有正常尿道的,而另一个是没有尿道的假阴茎,
